2. Verdenskrig var som for mange andre hård for Roskilde Fællesbageri. Især på grund af manglen på råvarer. Onsdag blev lavet til fast lukkedag, om søndagen lukkede brødudsalgene kl. 12, og der blev spændt heste for brødbilerne. Inden befrielsen blev bageriet tvunget til at levere 1.700 rugbrød til de tyske soldater i Roskilde – dagligt. Efter krigen gik man hastigt mod bedre tider, og store reklamekampagner for brødmærkerne ”Rutana” (mørkt brød) og ”Vitana” (lyst brød) så dagens lys.